2004年9月,，同濟(jì)大學(xué)通過公開招聘,，聘任美籍華人學(xué)者楊杰為生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院院長,、教授,。2005年3月,，在有關(guān)博士點申報材料中,，一篇2004年發(fā)表于《肺癌》（LUNG CANCER）雜志的論文,，被列入楊杰作為第一作者的論文清單,。經(jīng)查證,，該論文并非楊杰的成果,。文獻(xiàn)檢索所顯示的作者署名縮“J.YANG”，不是“JIE YANG（楊杰）”而是“JUN YANG（楊軍）”,。此前,，楊杰以第二作者的身份確實在《肺癌》雜志上發(fā)表過論文，但所刊出的論文是在填寫博士點申報材料之后,，故存在明顯造假,。
2005年7月，楊杰在申報長江學(xué)者特聘教授候選人的申請材料中,，再一次將JUN YANG在《肺癌》上發(fā)表的論文列入自己的成果清單,。
2006年3月，在申報國家自然科學(xué)基金重點和面上項目的材料中,，楊杰將他人承擔(dān)的國家“十五”攻關(guān)項目課題列入其承擔(dān)的科研項目欄目,。
經(jīng)校方深入調(diào)查后，楊杰的行為背離了一個教育工作者和學(xué)者基本的科學(xué)精神和誠信操守,，違反了學(xué)校和教育部《關(guān)于加強(qiáng)學(xué)術(shù)道德建設(shè)的若干意見》等規(guī)章制度,，根據(jù)同濟(jì)大學(xué)與其簽訂的聘任合同的有關(guān)條款，2006年3月,，同濟(jì)大學(xué)正式免去其院長職務(wù),；2006年6月，同濟(jì)大學(xué)決定終止與楊杰2007年7月到期的聘用合同,，解除其同濟(jì)大學(xué)教授職務(wù)的聘任,，楊杰不再從事任何教學(xué)事務(wù)。